日本農業食品產業技術綜合研究機構(以下簡稱「農研機構」)的西尾元秀主任研究員和石井和雄領域負責人等成功開發了一種可以根據基因體(全基因資訊)分析,將黑毛和牛的血緣關係的親近程度進行數值化的方法。該方法有助於實施血緣關係較遠的牛之間的交配,從而防止過度近親交配帶來的發育不良和受孕率降低,保持和牛的繁殖力。
研究團隊開發出了防止黑毛和牛近親交配的方法(供圖:日本家畜改良中心)
在以黑毛和牛爲代表的肉牛品種改良程序中,由於只使用極少數具有「初霜」等優良肉質的雄性作爲種牛,導致擁有相同種牛祖先的牛越來越多,加重了近親交配的情況。業界擔憂從雙親繼承了相似基因體的和牛更容易出現不利於發育的缺陷,繁殖能力降低的現象。
生物的遺傳資訊是由4種鹼基的序列決定的。即使是同一物種,序列的微小差異也會導致個別差異。農研機構和日本家畜改良中心的研究團隊着眼於黑毛和牛基因體中的「單鹼基多態性(SNP)」差異,從3萬多個SNP的資料中分析了鹼基序列吻合部分的長度,並將血緣關係的親近程度進行了數值化。研究證實,該方法與傳統使用牛譜系資訊計算的方法所得到的結果高度一致。
日本的農戶通常只能獲得牛過去三代的牛譜系資訊,因此很難準確判斷種牛和母牛之間的血緣關係。而此次開發的新方法即使在沒有譜系資訊的情況下也能使用。其成本僅1萬~2萬日元,低於檢測對比所有鹼基序列的方法。該方法還可應用於豬、羊等其他家畜。
日文:《日本經濟新聞》電子版、2024/4/26
中文:JST客觀日本編輯部
【論文資訊】
雜誌:BMC Genomics 24, 376 (2023)
論文:Comparing pedigree and genomic inbreeding coefficients, and inbreeding depression of reproductive traits in Japanese Black cattle
DOI:doi.org/10.1186/s12864-023-09480-5