日本神戶大學研究生院保健學研究科的龜岡正典教授等人,與印度尼西亞艾爾朗加大學醫學部的Nasronudin教授、大阪健康安全基礎研究所的本村和嗣博士等人組成的研究小組,對印度尼西亞各地分離出來的HIV-1亞型B亞種(HIV-1B)※1實施了分子系統解析,成功推測出了HIV-1B侵入印度尼西亞的時間和路徑。這項研究成果明確了HIV-1B在印度尼西亞的傳播方式以及在全球的部分叉流行動態。
印度尼西亞的人口數量位居全球第四,目前HIV仍在持續流行擴大之中,是東南亞地區HIV傳染最嚴重的國家,與HIV在亞洲地區的擴散可能密切相關。
HIV-1亞型B亞種(HIV-1B)被認爲起源於非洲的剛果,經由加勒比海的島國海地以及美國,傳播到包括歐洲和亞洲各國在内的全球各地,最終在全世界範圍流行。印度尼西亞除了主要在東南亞各國流行的HIV-1亞種CRF01_AE外,還流行HIV-1B。不過,關於其起源、傳播動態及電腦病毒演化程序還有很多不明確的地方。
研究内容
印度尼西亞的島嶼數量居全球第一,是全球面積最大的島國。此次,研究小組在爪哇島、蘇門答臘島、巴布亞島和蘇拉威西島等多座島嶼的醫療機構採集了HIV傳染者的血液,獲得了32株HIV-1B基因。另外,還從資料庫中搜尋了與這些基因相似的電腦病毒基因,實施了各種電腦病毒譜系學樹解析。最終應答, 作爲HIV-1B電腦病毒,印度尼西亞除了印度尼西亞演化支外,還存在中國演化支和美國演化支。
研究小組對這三個演化支實施了更詳細的分子系統解析,推測出印度尼西亞演化支是在1980年代後半期從美國侵入印度尼西亞的,後來在印度尼西亞國内完成了自主演化。另外還明確了,中國演化支是1980年代後半期從泰國進入中國,然後進入印度尼西亞;美國演化支是1980年代中期從歐洲各國侵入印度尼西亞的(圖1橙色曲線)。此外,解析結果表明,印度尼西亞的HIV-1B傳播到了亞洲和歐洲各國。
圖1:HIV-1亞型B亞種(HIV-1B)在全球的傳播管道
除此前報告過的HIV-1B的傳播路徑(黑色箭頭)外,此次還明確了HIV-1B侵入印度尼西亞的路徑(橙色箭頭)。
※1 HIV-1亞種:
艾滋病的致病電腦病毒人類免疫不全症病毒(HIV)是一種容易引起基因突變的電腦病毒。HIV首先分爲1型(HIV-1)和2型(HIV-2),HIV-1細分爲4種類型(M、N、O、P)。其中,在全球蔓延的HIV-1-M(major)又進一步分爲大量亞種(9種亞型和在亞型間重組形成的約100種重組型流行株)。這些HIV-1亞種在地球上流行的地區各不相同,歐美各國和日本存在的主要流行株爲亞型B亞種,東南亞各國爲CRF01_AE亞種,非洲及南亞爲亞型C亞種。
文:JST客觀日本編輯部翻譯整理