熊本大學人類逆轉錄電腦病毒學共同研究中心的佐藤賢文教授與佐賀大學勝屋弘雄助教、鹿兒島大學宇都宮與客座教授、聖瑪麗醫科大學山野嘉久教授等共同確立了全新的解析方法,能夠全方位高精度獲取被HTLV-1(人類T細胞白血病電腦病毒)傳染細胞中插入的電腦病毒DNA資訊。
日本目前約有HTLV-1傳染者80萬人左右,已知部分傳染者會轉化成癌症或慢性發炎等其他疾病。HTLV-1電腦病毒傳染細胞後會將自己的部分DNA插入整合到寄主細胞DNA中。整合到寄主細胞中的電腦病毒,是這些相關疾病的根本性病原。所以,獲取已整合進的電腦病毒DNA資訊對相關疾病的診斷及發病機理研究都具有極爲重要的意義。
一直以來,爲了準確掌握被HTLV-1傳染患者的電腦病毒傳染病理,需要結合多種解析方法來獲取電腦病毒DNA序列全長(判定是否有缺陷型)、電腦病毒DNA的結構、電腦病毒DNA插入位點、被傳染細胞的增殖情況等資訊。此次研究組建立的全新技術,整合了電腦病毒DNA獨特性探針和下一代測序技術,從而實施一次性對電腦病毒資訊進行全面高精度的解析(圖1)。
圖1 全面高精度解析HTLV-1 DNA的新技術
研究團隊進一步採用該新技術,解析了100名日本被傳染患者的詳細電腦病毒相關資訊。除了撰寫成論文公開發表,上述電腦病毒資訊資源也一併上傳到公共資料庫以供查閱,希望對後續HTLV-1的研究及相關疾病的診斷有所貢獻。
圖2 透過新技術獲取的電腦病毒相關資訊示例
採用DNA探針和下一代測序技術結合的新方法,不僅適用於HTLV-1的傳染病,而且可以依此類推應用於其他癌症相關的電腦病毒傳染病領域。本研究成果已於2019年10月15日發表在《Cell Reports》上[文獻1]。
參考文獻:
1. Katsuya H etc. The nature of HTLV-1 provirus in naturally infected individuals analyzed by viral DNA-capture-seq approach.
Cell Reports. 2019 Oct 15;29(3):724-735.e4.
DOI: 10.1016/j.celrep.2019.09.016.
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文:JST客觀日本編輯部翻譯整理