客觀日本

日本發現英國突變譜系的三種新毒株,或影響新冠在日本的流行趨勢

2021年02月05日 生物醫藥

本文根據東京醫科齒科大學成果發佈編譯而成

東京醫科齒科大學研究生院醫齒學綜合研究科電腦病毒控制學領域的武内寬明講師與醫學部附屬醫院院長助理、難治疾病研究所基因體解析室的谷本幸介助教及Research Core Center的田中Yukie助教等人組成的專案組透過與該校理事、副校長兼綜合研究機構主任木村彰方和醫學附屬醫院傳染控制部部長貫井質子合作,對該校附屬醫院住院患者的SARS-CoV-2基因體進行了解析,發現了此前從未在日本國內部流動行毒株中發現過的3種新英國毒株。

研究背景

2020年11月以後,日本的新冠電腦病毒傳染症(COVID-19)病例迅速增加,從2020年12月開始,因擔心傳染性已強化的英國SARS-CoV-2突變株(B.1.1.7毒株)及南非新突變株(B.1.351毒株)進入日本國内,日本政府從2020年12月底開始加強了邊境檢疫對策。

然而,2021年1月不僅發現了B.1.1.7毒株的社區傳染病例,還從來自巴西的旅客體内檢測出與上述2種突變株擁有相同突變位點的新突變株(B.1.1.248毒株)。這表明,日本已經難以阻止來自海外的各種SARS-CoV-2毒株的侵入。

研究概要

專案組對2020年7月以後在東京醫科齒科大學醫學部附屬醫院住過院的COVID-19患者的鼻咽拭子樣本中含有的SARS-CoV-2全長基因體序列進行了分析,目的是透過把(1)電腦病毒學特徵、(2)COVID-19流行病學資料及(3)臨牀特徵聯繫起來,爲COVID-19的病理調查及公衆衛生決策提供依據。

經過解析發現,從2020年11月下旬至12月下旬在該校附屬醫院住過院的患者樣本中發現了3種與日本國内目前的流行毒株(B.1.1.214譜系)和傳染性可能強化的SARS-CoV-2新突變株(UK突變株:B.1.1.7譜系、南非突變株:B.1.351譜系、巴西突變株:B.1.1.248譜系)不同的海外毒株,分別爲隸屬於英國毒株的B.1.1.4譜系、B.1.1.166譜系、B.1.1.220譜系。此次調查檢測出上述3種英國毒株的患者均無海外旅行史,因此這些傳染病例屬於社區獲得性傳染。

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表:已發現的SARS-CoV-2毒株一覽(紅框内爲此次應答的3種毒株)

此次新發現的3種英國毒株的社區傳染病例可能會影響日本國内目前的流行毒株的變化。另外,有2名傳染新發現的英國毒株的患者病情嚴重,因此新毒株還可能會加重臨牀病徵,不過,目前還難以判斷其對傳染性、病原性、檢查方法及疫苗的影響,需要繼續操作分析和調查。

日語發佈資料
編譯:JST客觀日本編輯部