本文根據東京醫科齒科大學成果發佈編譯而成
東京醫科齒科大學研究生院醫齒學綜合研究科電腦病毒控制學領域的武内寬明講師與醫學部附屬醫院院長助理、難治疾病研究所基因體解析室的谷本幸介助教及Research Core Center的田中Yuki助教等人組成的負責對該校附屬醫院住院患者的SARS-CoV-2基因體實施分析的專案組,透過與該校理事、副校長兼綜合研究機構主任木村彰方和醫學附屬醫院傳染控制部部長貫井質子共同進行分析發現,2020年秋季以後在該校附屬醫院住過院或者就過診的COVID-19患者中,各種海外毒株的傳染病例增加;另外還發現,其中一種海外毒株攜帶「免疫逃逸型突變(E484K突變)」,而且已導致多起社區獲得性傳染。
2020年11月以後,日本的新冠電腦病毒傳染症(COVID-19)病例迅速增加,從2020年12月下旬開始,傳染性已被證明強化的英國型突變株(B.1.1.7毒株)、南非型突變株(B.1.351毒株)及巴西型突變株(P.1毒株)逐漸在日本國内出現。自2021年1月以來,已檢測出多例B.1.1.7毒株的社區獲得性傳染病例,因此政府需要採取更嚴格措施來預防傳染蔓延。
東京醫科齒科大學在2020年11月下旬至12月下旬發現了疑似從海外進入日本的3種英國毒株(B.1.1.4毒株、B.1.1.166毒株、B.1.1.220毒株)傳染病例,此前已報告過這些傳染病例屬於社區獲得性傳染(keguanjp.com/kgjp_keji/kgjp_kj_smkx/pt20210205000004.html)。此次爲其後續報告,研究團隊從2020年12月下旬至2021年1月中旬在該校附屬醫院住過院或者就過診的11例患者樣本中,發現了與上次報告的病例不同的海外毒株(B.1.1.130毒株、B.1.1.64毒株、B.1.346毒株、B.1.316毒株)傳染病例。另一方面,發現2020年底以前檢測出的日本毒株(B.1.1.214及B.1.1.284兩種毒株)傳染病例在逐漸減量。另外還發現,此次應答的海外毒株中有一種攜帶「免疫逃逸型突變(E484K突變)」。該毒株已發現有3例傳染患者,且均無海外旅行史或相互接觸史。
表:東京醫科齒科大學在2020年12月下旬至2021年1月中旬發現的SARS-CoV-2毒株一覽
淡藍色爲攜帶E484K突變的海外毒株
2020年底以後已從東京醫科齒科大學的樣本中發現多例海外毒株的傳染病例,另外,2020年3月及7月以後應答的2種不同的國內部流動行毒株(B.1.1.214及B.1.1.284兩種毒株)在逐漸減量,因此,目前日本國内的流行毒株可能正逐漸變爲海外毒株。
此外,具有「免疫逃逸型突變(E484K突變)」的海外毒株不僅有該校應答的B.1.316毒株,日本國立傳染症研究所還報告了其他毒株(B.1.1.4突變)也具有這種突變。這些海外毒株雖然沒有攜帶傳染性可能強化的突變,但仍要繼續操作觀測。
表:攜帶傳染性可能強化的突變和免疫逃逸型突變的SARS-CoV-2毒株一覽
·關於毒株譜系
新冠電腦病毒的譜系名稱是利用基於全球通用的的譜系分類方法Pangolin(COVID-19 Lineage Assigner Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak LINeages)進行分類的。
·免疫逃逸型突變(E484K突變)
E484K突變是在存在COVID-19復健患者血清(含有抑制SARS-CoV-2傳染的中和抗體)的情況下,依然保持傳染能力的SARS-CoV-2突變,可能會削弱中和抗體的效果。
·加拿大毒株
根據Pangolin譜系分類被定義爲B.1.316譜系毒株的SARS-CoV-2,在美國、比利時和加拿大等發現多起傳染病例。
·日本毒株
根據Pangolin譜系分類被定義爲B.1.214及B.1.284譜系毒株的SARS-CoV-2,90%以上的傳染病例發生在日本。
·什麼是免疫(基於中和抗體的免疫)逃逸?
日語發佈資料
編譯:JST客觀日本編輯部