青木 航(大阪大學 研究生院工學研究科 教授)
|全球首次實現試管內的核糖體合成
大阪大學研究生院工學研究科的青木航教授等人組成的研究團隊,全球首次成功地在試管內利用基因合成出了作為細胞內蛋白質工廠的核糖體。核糖體擁有由約200種分子協同而成的複雜結構,一直被認為難以在試管內人工再現。
研究團隊基於「在試管內再現與細胞內相同的環境」這一方針,通過在適宜條件下組合必需因子,成功由基因合成出了核糖體。
|為何製備人工核糖體至關重要?
核糖體存在於生物細胞內,可依據遺傳資訊連接氨基酸,合成蛋白質。若對核糖體進行人為改造,摻雜自然界不存在的非天然單體,就有望製備出具備前所未有功能的藥物與有用的酶。
然而,研究已知,若對生物細胞內的核糖體進行改造,就會產生毒性,導致細胞無法正常發揮功能。另一方面,也有研究長期致力於改造核糖體以外的分子,使核糖體能夠使用非天然單體作為材料※1。此前,已成功合成出了常規核糖體作為合成材料不擁有的10數個氨基酸。但要實現非天然單體的高效聚合,最終仍需對核糖體本身進行改造。
為此,研究團隊認為,若不使用細胞,卻能在試管內人工合成出核糖體的話,便可無需顧慮細胞毒性,自由地對核糖體進行改造。
※1 非天然單體:具有生物通常不使用的化學結構的分子。作為製備具有新性質的分子的原料而備受期待。
|在試管內再現細胞內環境
核糖體經過複雜的過程被合成
生物體內的核糖體是經過極複雜的過程被合成出來的。例如,大腸桿菌的核糖體由3種核糖體RNA ※2和54種蛋白質構成,還需近百種輔助蛋白發揮作用才能完成合成。僅具備原料無法生成核糖體,各構成要素需按既定的順序結合,在不同階段逐步改變結構的同時完成構造。
正因為這一過程的複雜性,此前一直難以人工製備出與生物體內核糖體功能一致的分子。
※2 核糖體RNA:構成核糖體的RNA,參與蛋白質合成反應。
構建細胞內環境
研究團隊認為「若能在試管中再現與細胞內相同的環境,就能合成出核糖體」。
研究團隊首先壓碎大腸桿菌,獲得S150壓碎液。這種溶液包含形成核糖體所需的多種輔助蛋白。之後再向其中加入生物體內富含的小分子化合物,再現出了接近生物細胞內的環境。接下來,向其中加入了天然核糖體、RNA聚合酶、核糖體RNA基因,以及54種核糖體蛋白基因(圖1)。
圖1 在試管內合成核糖體
研究團隊通過多次優化反應條件,最終成功地在試管內由基因合成出了核糖體。這一成果是全球首例在完全人工環境下合成出核糖體的事例。
|理解核糖體,邁向有用物質的合成
已知核糖體可將我們體內的氨基酸用於合成,卻幾乎不將非天然單體用作合成材料。為何會存在這種差異?這一根本性疑問此前始終未得到闡明。本次研究成功地構建了人工核糖體,讓此前難以實現的核糖體改造與評價成為可能,有望為理解核糖體的機制做出巨大貢獻(圖2)。
圖2 人工核糖體的可能性
如果能夠設計人工核糖體,實現非天然單體的高效聚合,就有望開發出易於體內吸收、可作為口服藥物使用的優質藥物,以及不易降解、穩定性高的工業用酶,低環境負荷的生物塑膠等。特別是,若能高效處理D-氨基酸,就向開發出參與前所未有的新反應的酶,以及具有高分解耐性的藥物邁進了一步。
原文:JST 事業成果 生命科學領域
翻譯:JST客觀日本編輯部
【論文資訊】
期刊:Nature Communications
論文:Autonomous ribosome biogenesis in vitro
DOI:doi.org/10.1038/s41467-025-55853-7


